Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TWISTNBQ3B726 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms