Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPHKAPQ2M3C7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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