Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PTPRNQ16849 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms