Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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PTPROQ16827 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPROQ16827 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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