Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLPPQ16740 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms