Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SGCBQ16585 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGCBQ16585 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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