Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDB1Q16531 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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DDB1Q16531 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDB1Q16531 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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