Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CHRNA2Q15822 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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