Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
UBE3CQ15386 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms