Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDGFRLQ15198 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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