Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NCAPHQ15003 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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