Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CKAP5Q14008 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms