Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALCAMQ13740 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALCAMQ13740 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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