Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ITGB3BPQ13352 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ITGB3BPQ13352 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms