Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-212ENST00000589791 1329 ntTSL 221.83■■□□□ 1.091e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-208ENST00000588450 2858 ntTSL 220.07■□□□□ 0.81e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.592e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PHB-206ENST00000504124 796 ntTSL 515.26■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PHB-202ENST00000393345 847 ntTSL 213.06□□□□□ -0.323e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PHB-213ENST00000513412 650 ntTSL 212.57□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PHB-207ENST00000506273 431 ntTSL 512.33□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PHB-204ENST00000434917 534 ntTSL 412.28□□□□□ -0.443e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PHB-203ENST00000419140 907 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PHB-205ENST00000446735 732 ntTSL 511.16□□□□□ -0.623e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 B2M-207ENST00000559907 499 ntTSL 316.98■□□□□ 0.313e-18■■□□□ 13
PABPC4Q13310 EIF3E-212ENST00000521614 1990 ntTSL 23.42□□□□□ -1.861e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 WDR83OS-203ENST00000598732 627 ntTSL 213.61□□□□□ -0.231e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 WDR83OS-201ENST00000222190 599 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.294e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 528.34■■■□□ 2.139e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NT5C-202ENST00000577523 776 ntTSL 226.75■■□□□ 1.879e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 OXLD1-206ENST00000575963 1600 nt25.77■■□□□ 1.724e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)25.27■■□□□ 1.649e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.639e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.539e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.519e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.442e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 322.71■■□□□ 1.239e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 222.7■■□□□ 1.229e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 521.94■■□□□ 1.19e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.039e-9■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 321.39■■□□□ 1.019e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 NT5C-208ENST00000580423 450 ntTSL 220.62■□□□□ 0.899e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 STUB1-208ENST00000566408 684 ntTSL 220.3■□□□□ 0.844e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.719e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 418.66■□□□□ 0.589e-14■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 218.44■□□□□ 0.549e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.24e-6■■□□□ 13
PABPC4Q13310 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.069e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 DGCR8-209ENST00000495826 4695 ntTSL 1 (best)15.25■□□□□ 0.039e-14■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.024e-6■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 DGCR8-203ENST00000407755 4129 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.319e-14■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-7■■□□□ 13
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PABPC4Q13310 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.017e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.037e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PSMB1-202ENST00000462957 1939 ntTSL 26.05□□□□□ -1.441e-39■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.989e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.789e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.69e-8■■□□□ 13
PABPC4Q13310 RPL19-203ENST00000577759 564 nt12.32□□□□□ -0.441e-16■■□□□ 13
PABPC4Q13310 HADHA-204ENST00000492433 752 ntTSL 212.42□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 FLOT1-209ENST00000476729 562 ntTSL 218.72■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 13
PABPC4Q13310 UBE2S-202ENST00000587845 743 ntTSL 228.71■■■□□ 2.191e-10■■□□□ 13
PABPC4Q13310 PGAM1-202ENST00000467867 1187 ntTSL 214.46□□□□□ -0.096e-37■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.23e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMED10-205ENST00000556969 1314 ntTSL 27□□□□□ -1.293e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.623e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.543e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.493e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-210ENST00000478631 5204 ntTSL 213.27□□□□□ -0.293e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.993e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-216ENST00000533119 742 ntTSL 56.25□□□□□ -1.413e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.483e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SCP2-211ENST00000484100 671 ntTSL 25.3□□□□□ -1.563e-14■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MRPL55-230ENST00000489430 847 ntTSL 522.92■■□□□ 1.261e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 COX7B-202ENST00000475465 685 ntTSL 211.07□□□□□ -0.644e-10■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.061e-8■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.91e-8■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.161e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.632e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PPOX-217ENST00000539753 816 ntTSL 517.36■□□□□ 0.375e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PPOX-203ENST00000460611 514 ntTSL 315.21■□□□□ 0.035e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMED3-204ENST00000543455 1483 ntTSL 222.41■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.952e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.352e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.63e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SF3B2-210ENST00000530981 1080 ntTSL 510.82□□□□□ -0.683e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.683e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-16■■□□□ 12.9
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