Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR1H3Q13133 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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NR1H3Q13133 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NR1H3Q13133 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NR1H3Q13133 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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