Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF1Q13077 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAF1Q13077 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms