Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NPRL3Q12980 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NPRL3Q12980 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms