Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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