Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PUDPQ08623 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms