Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
LRP1Q07954 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
LRP1Q07954 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms