Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOS1Q07889 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms