Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK18Q07002 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK18Q07002 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK18Q07002 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK18Q07002 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK18Q07002 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK18Q07002 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK18Q07002 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms