Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX2Q04743 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms