Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MS4A2Q01362 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms