Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E2F1Q01094 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E2F1Q01094 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms