Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC42EP1Q00587 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms