Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITX1P78337 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms