Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCAF7P61962 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCAF7P61962 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms