Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
HERVK_113P61574 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms