Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ABCE1P61221 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms