Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
TMEM258P61165 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
TMEM258P61165 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms