Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACLYP53396 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACLYP53396 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms