Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IDH3AP50213 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IDH3AP50213 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms