Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms