Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CAPGP40121 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CAPGP40121 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms