Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGM1P36871 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGM1P36871 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PGM1P36871 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PGM1P36871 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PGM1P36871 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms