Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CTNNB1P35222 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms