Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKBRP32239 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms