Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5DP30049 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms