Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM5AP29375 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms