Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHC1P29353 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms