Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GJB2P29033 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GJB2P29033 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB2P29033 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GJB2P29033 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GJB2P29033 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms