Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GCAP28676 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GCAP28676 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCAP28676 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCAP28676 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCAP28676 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCAP28676 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GCAP28676 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCAP28676 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCAP28676 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms