Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACGP22612 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACGP22612 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms