Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC9A1P19634 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC9A1P19634 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms