Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA1P14867 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms