Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD8P13378 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms