Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMP3P12645 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BMP3P12645 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BMP3P12645 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BMP3P12645 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMP3P12645 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BMP3P12645 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms