Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GFRA3O60609 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GFRA3O60609 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms